醫藥行業對壓縮空氣的質量要求很高，這類對氣體有嚴格要求的行業在選擇空壓機時往往都會選無油空壓機，無油空壓機因其是采用水潤滑的所以一般壓縮空氣中是不含有油分的氣體清潔度高不會對成品產生污染。
1、膠囊藥片。從混合，硬化和造粒到干燥，壓制，涂層和包裝，每一步都會用到壓縮空氣，壓縮空氣在制造過程幾乎每一步都與藥物接觸，如果壓縮空氣中含有油分水分或其它雜質就會使藥物受到污染。所以即使使用的是無油空壓機也是需要配置后處理設備。
2、發酵。發酵罐通過無菌空氣充氣。如果無菌空氣被污染，最終產品會被污染。
3、儀表空氣，整個制造過程中使用的工具都是由壓縮空氣提供燃料。因為來自工具的空氣與產品接觸，所以它必須是純凈且無油的。
4、裝瓶，罐裝和包裝。醫藥可以多種方式包裝，包括泡罩包裝，藥瓶，輕質塑料容器和紙箱。根據產品的不同，壓縮空氣可用于清潔和去除這些包裝中的水分。
5、干燥，干燥藥物以從產品中除去任何類型的溶劑或水。該過程通常用真空泵完成，真空泵有助于從固體中蒸發液體。
無油空壓機在醫藥行業中的應用主要體現在以上幾個方面。實際工作中經常會遇到生產出來的產品表面有油分，出現這類情況原因主要是由于生產設備中的潤滑劑或使用噴油空壓機所致。當然如果使用的是無油空壓機就不會出現這類情況。
